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L’effet de la percée d’Omicron sur l’ampleur et la portée de l’activité neutralisante sérique et des cellules B mémoire chez les vaccinés BNT162b2

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Dans une étude récente publiée dans Science Immunologie, les chercheurs ont évalué l’impact d’infections percutantes par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) de la sous-lignée Omicron BA.1 sur la neutralisation des variants préoccupants (VOC) du SRAS-CoV-2 et la mémoire B (BMEM) formation de lymphocytes chez les vaccinés BNT162b2.

Étude : L'infection percée par Omicron BA.1 entraîne une neutralisation croisée et la formation de lymphocytes B mémoire contre des épitopes conservés. Crédit image : ffikretow/Shutterstock
Étude : L’infection percée par Omicron BA.1 entraîne une neutralisation croisée et la formation de cellules B mémoire contre des épitopes conservés. Crédit image : ffikretow/Shutterstock

Contexte

Des réponses immunitaires durables et étendues sont nécessaires à la protection contre les COV existants et les variantes qui doivent encore apparaître. Les titres d’anticorps neutralisants et d’anticorps se liant à la protéine spike (S) du SRAS-CoV-2 et à son domaine de liaison au récepteur (RBD) ont été établis comme corrélats de la protection contre les infections par le SRAS-CoV-2.

Mémoire à longue durée de vie BMEM Les lymphocytes sont essentiels au développement de réponses immunitaires de rappel lors d’une nouvelle rencontre avec les antigènes du SRAS-CoV-2 et à l’évolution et au maintien des réponses d’anticorps contre les COV en élargissant le champ de reconnaissance des variantes.

A propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont caractérisé les réponses immunitaires de neutralisation et de rappel chez les personnes ayant reçu le vaccin BNT162b2 à base d’acide ribonucléique messager (ARNm) et ayant contracté une infection de la sous-lignée Omicron BA.1 contre les nouveaux VOC Omicron BA.4/5 et les anciens VOC .

Des sérums ont été obtenus auprès de personnes doublement ou triplement vaccinées par BNT162b2 qui ont développé des infections de la sous-lignée Omicron BA.1 entre novembre 2021 et mi-janvier 2022. Des tests de neutralisation de pseudovirus (pVNT) et des tests de neutralisation de virus vivants (VNT) ont été réalisés pour évaluer l’inhibition de l’entrée du SRAS-CoV-2 et la neutralisation des variants du SRAS-CoV-2, respectivement.

Pour les tests pVNT, des pseudovirus avec la protéine S des souches de SARS-CoV-2 telles que Wuhan-Hu-1, Alpha, Beta, Delta, Omicron BA.1, BA.2, BA.4/5 ont été utilisés. Des tests de phénotypage des lymphocytes B basés sur la cytométrie en flux ont été réalisés pour détecter les lymphocytes B spécifiques de la variante S à partir des cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC). De plus, des tests SARS-CoV-1 ont été effectués pour évaluer la puissance de neutralisation du pan-sarbecovirus.

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BMEM Les lymphocytes ont été colorés avec du S ou du RBD spécifique de la variante marqué par fluorescence pour évaluer la spécificité de la réponse des anticorps. Un alignement de séquences multiples a également été réalisé. En outre, l’approche booléenne combinatoire a été utilisée pour différencier les anticorps BMEM des sous-ensembles de lymphocytes capables de reconnaître des épitopes spécifiques de la variante et des épitopes conservés à travers les VOC.

Résultats

Chez les personnes naïves de l’infection à Omicron et doublement vaccinées, la neutralisation de 50 % du pseudovirus (pVNT50), les titres moyens géométriques (TMG) pour Delta et Beta ont diminué, et ceux pour Omicron BA.1, BA.2 et BA.4/5 étaient indétectables. La troisième dose de vaccin BNT162b2 a entraîné une augmentation significative du pVNT50 GMTs pour Alpha (B.1.1.7), Beta (B.1.351)et Delta (B.1.617.2); cependant, des GMT de 160, 211, et 74 ont été obtenus pour les sous-lignées Omicron BA.1, BA.2 et BA.4/5, respectivement, qui étaient sensiblement inférieurs à ceux de la souche Wuhan-Hu-1 (GMT 398).

Par rapport à la souche pVNT50 Les GMT pour BA.1, BA.2 et BA.4/5 chez les personnes doublement vaccinées naïves par Omicron, les GMT correspondants chez les convalescents doublement vaccinés par Omicron BA.1 étaient 100 fois, 35 fois et 15 fois plus élevés, respectivement. Les TGM des convalescents Omicron BA.1 étaient plus élevés que ceux des participants triplement vaccinés naïfs à l’Omicron.

Les convalescents BA.1 triplement vaccinés ont montré un pVNT élevé.50 GMT de 1182, 1029, et 836 pour Beta, Omicron BA.1, et Omicron BA.2, respectivement, qui étaient comparables à ceux de la souche Wuhan-Hu-1 (GMT 1182). Cependant, les titres de neutralisation de l’Omicron BA.4/5 (GMT 197) n’ont augmenté que modérément et étaient plus comparables aux titres du SARS-CoV-1 qu’à ceux de la souche Wuhan-Hu-1.

Les essais de neutralisation du SRAS-CoV-2 ont montré que les TGM de neutralisation contre l’Omicron BA.1, la souche Wuhan-Hu-1 et tous les COV étaient comparables chez les convalescents de l’Omicron BA.1, indiquant une forte neutralisation croisée, mais avec une puissance considérablement réduite contre l’Omicron BA.4/5. En outre, les tests de phénotypage des lymphocytes B ont montré que tous les lymphocytes B ciblés par S et RBD dans les échantillons de sang périphérique appartenaient au groupe BMEM phénotype [cluster of differentiation (CD)20highCD38int/neg].

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La fréquence de BMEM lymphocytes chez les individus naïfs Omicron doublement vaccinés ont augmenté progressivement après la vaccination. Par rapport à trois semaines après la double vaccination BNT162b2, à cinq mois, les lymphocytes BMEM contre tous les COV ont été multipliés par quatre et par trois, respectivement.

La plupart des lymphocytes BMEM Les lymphocytes provenant d’individus doublement vaccinés naïfs d’Omicron et encore plus d’individus triplement vaccinés étaient dirigés contre des épitopes partagés par les souches Wuhan-Hu-1 et Omicron BA.1. Les personnes vaccinées contre les infections percées par la souche Omicron BA.1 ont présenté un taux de lymphocytes BMEM contre les épitopes S et RBD conservés, plutôt que contre les épitopes BMEM lymphocytes.

L’alignement de séquences multiples a révélé que le RBD Omicron BA.1 diverge des sites de séquence RBD conservés dans les souches Wuhan-Hu-1, Alpha et Delta par 13 mutations. En conséquence, la plus importante mutation BMEM La population lymphocytaire détectée chez les convalescents BA.1 a reconnu les RBD Wuhan-Hu-1, Alpha et Delta, mais pas le RBD Omicron BA.1.

Le BMEM Les réponses de rappel des lymphocytes contre le RBD étaient motivées par les spécificités induites par les vaccinations antérieures par BNT162b2 et n’ont pas été réorientées de manière significative contre les nouveaux épitopes du RBD présentés par Omicron BA.1. La mutation L452R a été identifiée comme étant unique à Delta et Omicron BA.4/5, et la mutation unique à Wuhan-Hu-1 et Alpha était T478K. Les mutations L452R et T478K ont conféré des propriétés immuno-évasives aux variants correspondants.

Conclusion

Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que les infections percutantes avec Omicron BA.1 ont entraîné des titres de neutralisation robustes pour Omicron BA.1, BA.2 et les COV antérieurs du SRAS-CoV-2, mais pas pour Omicron BA.4/5 chez les vaccinés BNT162b2. En outre, de fortes réponses de mémoire/rappel ont été suscitées par les convalescents Omicron BA.1 avec l’expansion de BMEM contre les épitopes du SRAS-CoV-2 conservés dans les COV au lieu de l’induction de lymphocytes B spécifiques à Omicron BA.1.

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Apasionado del running, vegano a los 25 años y comercial de la ropa, me incorporé al equipo de redacción de AltaVision.news en noviembre de 2021